Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa2P28309 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms