Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb3P28231 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms