Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjc1P28229 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms