Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BrafP28028 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BrafP28028 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BrafP28028 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BrafP28028 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms