Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afxP27661 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afxP27661 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms