Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl3P27659 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl3P27659 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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