Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ChgaP26339 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ChgaP26339 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms