Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccnd1P25322 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnd1P25322 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms