Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf239P24399 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms