Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd11P23813 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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