Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd12P23812 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms