Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd8P23463 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd8P23463 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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