Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gja1P23242 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms