Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PparaP23204 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PparaP23204 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PparaP23204 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PparaP23204 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms