Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tap1P21958 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tap1P21958 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tap1P21958 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms