Protein–RNA interactions for Protein: P21761

Trhr, Thyrotropin-releasing hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhrP21761 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TrhrP21761 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrhrP21761 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TrhrP21761 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms