Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxb9P20615 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxb9P20615 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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