Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ms4a1P19437 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a1P19437 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms