Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NelfeP19426 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms