Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpl13aP19253 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl13aP19253 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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