Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NefhP19246 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NefhP19246 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NefhP19246 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms