Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18526 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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P18526 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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P18526 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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P18526 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18526 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18526 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18526 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18526 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18526 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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