Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfb3P17125 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms