Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgbP16014 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms