Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rag1P15919 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rag1P15919 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms