Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmnb1P14733 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms