Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calb1P12658 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms