Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nid1P10493 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nid1P10493 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nid1P10493 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms