Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hoxb4P10284 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hoxb4P10284 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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