Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms