Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Amd1P0DMN7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms