Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms