Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc8P09025 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc8P09025 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms