Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtrP07309 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtrP07309 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtrP07309 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtrP07309 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtrP07309 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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TtrP07309 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TtrP07309 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TtrP07309 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms