Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TnfP06804 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TnfP06804 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms