Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apoa4P06728 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms