Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfrbP05622 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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