Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04214 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04214 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04214 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04214 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P04214 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms