Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01668 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01668 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01668 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01668 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms