Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01653 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01653 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01653 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01653 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01653 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01653 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01653 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01653 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01653 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms