Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifnb1P01575 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifnb1P01575 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms