Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccl20O89093 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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