Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sp1O89090 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sp1O89090 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms