Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
JtbO88824 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
JtbO88824 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
JtbO88824 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
JtbO88824 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
JtbO88824 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
JtbO88824 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JtbO88824 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms