Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3aO88508 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms