Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vamp4O70480 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vamp4O70480 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms