Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms