Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs5O54928 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Socs5O54928 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Socs5O54928 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms