Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f6O54917 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f6O54917 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2f6O54917 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E2f6O54917 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms