Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb3O54890 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb3O54890 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms